MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591276
2	NC_002929	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591276
3	NC_002929	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591276
4	NC_002929	G	6	6	154	159	0 %	0 %	100 %	0 %	33591276
5	NC_002929	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591276
6	NC_002929	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
7	NC_002929	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
8	NC_002929	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591276
9	NC_002929	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591276
10	NC_002929	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33591276
11	NC_002929	TCC	2	6	531	536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591276
12	NC_002929	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591276
13	NC_002929	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591276
14	NC_002929	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33591276
15	NC_002929	GT	3	6	638	643	0 %	50 %	50 %	0 %	33591276
16	NC_002929	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
17	NC_002929	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33591276
18	NC_002929	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591276
19	NC_002929	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33591276
20	NC_002929	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591276
21	NC_002929	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33591276
22	NC_002929	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591276
23	NC_002929	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591276
24	NC_002929	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591276
25	NC_002929	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591276
26	NC_002929	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
27	NC_002929	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591276
28	NC_002929	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591276
29	NC_002929	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
30	NC_002929	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
31	NC_002929	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591276
32	NC_002929	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591276
33	NC_002929	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	33591276
34	NC_002929	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
35	NC_002929	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33591276
36	NC_002929	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
37	NC_002929	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
38	NC_002929	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591276
39	NC_002929	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
40	NC_002929	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33591276
41	NC_002929	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591277
42	NC_002929	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
43	NC_002929	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591277
44	NC_002929	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591277
45	NC_002929	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591277
46	NC_002929	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33591277
47	NC_002929	CGC	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591277
48	NC_002929	GC	4	8	2167	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
49	NC_002929	CGG	3	9	2198	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591277
50	NC_002929	GTG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591277
51	NC_002929	CAT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591277
52	NC_002929	GC	3	6	2234	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
53	NC_002929	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591277
54	NC_002929	GC	3	6	2305	2310	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
55	NC_002929	GTG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591277
56	NC_002929	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
57	NC_002929	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591277
58	NC_002929	TCG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591277
59	NC_002929	TGG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591277
60	NC_002929	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
61	NC_002929	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591278
62	NC_002929	ACC	3	9	2678	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591278
63	NC_002929	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	33591278
64	NC_002929	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591278
65	NC_002929	TGC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591278
66	NC_002929	TCGATC	2	12	2739	2750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33591278
67	NC_002929	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591278
68	NC_002929	CG	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
69	NC_002929	CGG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591278
70	NC_002929	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591278
71	NC_002929	CGAGCG	2	12	2935	2946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591278
72	NC_002929	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591278
73	NC_002929	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
74	NC_002929	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591278
75	NC_002929	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	33591278
76	NC_002929	TCA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591278
77	NC_002929	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591278
78	NC_002929	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591278
79	NC_002929	GCA	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591278
80	NC_002929	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591278
81	NC_002929	GGT	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591278
82	NC_002929	GTG	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591278
83	NC_002929	CG	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
84	NC_002929	CG	3	6	3336	3341	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
85	NC_002929	GC	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
86	NC_002929	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	33591279
87	NC_002929	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591279
88	NC_002929	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	33591279
89	NC_002929	GC	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
90	NC_002929	GGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
91	NC_002929	CCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591279
92	NC_002929	GC	3	6	3569	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
93	NC_002929	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591279
94	NC_002929	GGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
95	NC_002929	CGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591279
96	NC_002929	GGC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
97	NC_002929	GCT	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591279
98	NC_002929	GCG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
99	NC_002929	GGC	2	6	3925	3930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
100	NC_002929	CGC	2	6	3972	3977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591279
101	NC_002929	GCG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
102	NC_002929	GCG	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
103	NC_002929	CGG	2	6	4002	4007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591279
104	NC_002929	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	33591279
105	NC_002929	GC	4	8	4044	4051	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
106	NC_002929	GCC	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591279
107	NC_002929	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591280
108	NC_002929	ACA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591280
109	NC_002929	CCG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
110	NC_002929	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	33591280
111	NC_002929	GC	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
112	NC_002929	CGCGCA	2	12	4375	4386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33591280
113	NC_002929	GC	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
114	NC_002929	CAT	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591280
115	NC_002929	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	33591280
116	NC_002929	ATC	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591280
117	NC_002929	CG	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
118	NC_002929	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
119	NC_002929	AAG	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591280
120	NC_002929	CGA	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591280
121	NC_002929	CGC	2	6	4583	4588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
122	NC_002929	CGC	2	6	4656	4661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
123	NC_002929	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591280
124	NC_002929	GCC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
125	NC_002929	CCA	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591280
126	NC_002929	CTG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591280
127	NC_002929	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591280
128	NC_002929	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	33591280
129	NC_002929	GCC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
130	NC_002929	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
131	NC_002929	CGC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591280
132	NC_002929	AAG	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591280
133	NC_002929	CG	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
134	NC_002929	ATC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591280
135	NC_002929	CG	3	6	5011	5016	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
136	NC_002929	GCT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591280
137	NC_002929	ACG	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591281
138	NC_002929	CGG	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591281
139	NC_002929	ACG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591281
140	NC_002929	CGG	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591281
141	NC_002929	GAGACG	2	12	6932	6943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33591281
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143	NC_002929	TGC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591281
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145	NC_002929	CG	3	6	7068	7073	0 %	0 %	50 %	50 %	33591281
146	NC_002929	CAT	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591281
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172	NC_002929	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	33591282
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253	NC_002929	ACCGGC	2	12	12064	12075	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33591288
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255	NC_002929	TTC	2	6	12139	12144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591288
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260	NC_002929	CTT	2	6	12342	12347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591288
261	NC_002929	GGC	2	6	12379	12384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591288
262	NC_002929	ATG	2	6	12385	12390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591288
263	NC_002929	TCG	2	6	12395	12400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591288
264	NC_002929	GC	3	6	12424	12429	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
265	NC_002929	TCG	2	6	12461	12466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591288
266	NC_002929	CGG	2	6	12513	12518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591288
267	NC_002929	TCG	2	6	12578	12583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591288
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271	NC_002929	CGA	2	6	12735	12740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591288
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384	NC_002929	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	33591289
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394	NC_002929	CGT	2	6	18314	18319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591289
395	NC_002929	CGA	2	6	18365	18370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591289
396	NC_002929	CGC	2	6	18424	18429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591289
397	NC_002929	GC	3	6	18457	18462	0 %	0 %	50 %	50 %	33591289
398	NC_002929	CGC	2	6	18527	18532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591289
399	NC_002929	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	33591289
400	NC_002929	CGA	2	6	18731	18736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591289
401	NC_002929	CGCGAG	2	12	18744	18755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591289
402	NC_002929	GCG	2	6	18871	18876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591289
403	NC_002929	GAA	2	6	18897	18902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591289
404	NC_002929	CGA	2	6	18926	18931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591289
405	NC_002929	CG	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	33591289
406	NC_002929	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	33591289
407	NC_002929	CAG	2	6	19110	19115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591289
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409	NC_002929	CGG	2	6	19178	19183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591289
410	NC_002929	CG	3	6	19189	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	33591289
411	NC_002929	AGC	2	6	19288	19293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591289
412	NC_002929	TCA	2	6	19300	19305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591289
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430	NC_002929	CGG	2	6	19961	19966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591289
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435	NC_002929	CGG	2	6	20353	20358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591290
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486	NC_002929	G	6	6	24679	24684	0 %	0 %	100 %	0 %	33591292
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492	NC_002929	GGC	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
493	NC_002929	TGC	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591292
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495	NC_002929	CGG	2	6	25150	25155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
496	NC_002929	ACC	2	6	25176	25181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591292
497	NC_002929	GCC	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591292
498	NC_002929	GTC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591292
499	NC_002929	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33591292
500	NC_002929	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	33591292

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